A vizsgálatok azt mutatják, hogy az autizmussal összefüggő viselkedési eltérések az agy eltérő működésével állnak összefüggésben. Egyes idegrendszeri funkciók eltérően fejlődnek a fejlődési zavar következtében, ahogy egy Asperger szindrómás nő fogalmazott: „Másként vagyok bedrótozva.”

Az autizmussal élő emberek sokszor nehezen értik a többi ember szándékát, gondolatait, érzéseit, mások nézőpontját, ezért nehezen tudják kiszámítani és értelmezni mások viselkedését. Sokszor félreértik, túl „komolyan” veszik, vagy – nem érzékelve, hogy a másikban ez milyen érzést, gondolatot kelthet – túlságosan (sokszor „tapintatlanul”) őszinték, vagy nem odaillő információkat osztanak meg.

Ha nem tudjuk, hogy a kliensünk autizmussal él vagy nem vagyunk tisztában az autizmus természetével, viselkedése alapján könnyen gondolhatjuk például, hogy „udvariatlan”, „provokál”, „érzéketlen” vagy „értelmileg sérült”.